自1952年全國高校院系調整后，東南大學就開始招收研究生，20世紀50年代后期至60年代初期共招收研究生117人，1978年恢復招收研究生。1981年實施學位條例后，首批獲學士、碩士、博士學位授予權；首批建有博士后流動站的單位；首批進入國家“985工程”和“211工程”；2017年進入一流大學建設高校A類名單；是自行審批博士和碩士學位授予權、自行審定增列博士生指導教師的試點單位；首批獲準招收和培養工程碩士生；首批獲準開展工程博士專業學位授予工作。1986年4月經國務院批準試辦研究生院，1996年3月經國家教委批準，正式建立研究生院。東南大學與國內許多重點高校一樣，已成為我國研究生教育與培養的一個重要基地。

東南大學現有專任教師3141余人，具有博士學位的教師2764人，正、副高級職稱2123人，博士研究生指導教師1171人，碩士研究生指導教師2290人，兩院院士12人，歐洲科學院院士2人，國務院學位委員會第八屆學科評議組成員13人?，F有37個博士學位授權一級學科點，49個碩士學位授權一級學科點，覆蓋了哲學、經濟學、法學、教育學、文學、理學、工學、醫學、管理學、藝術學等多個學科。有在校研究生22885人，其中全日制研究生19813人，非全日制研究生3072人，已授予博士學位9004名，碩士學位67996名。

在東南大學創建世界一流大學發展目標的驅動下，學校的優勢學科確立了以世界一流學科為標桿建設高峰學科的目標，學科建設水平得到了整體提升。工程學、計算機科學、材料科學、數學、物理學、化學、臨床醫學、生物學與生物化學、藥理學與毒理學、神經科學與行為科學、社會科學總論、環境科學與生態學、其中工程學列15位，進入ESI世界前萬分之一，計算機科學列11位，進入ESI世界前千分之一。經過“985工程”、“211工程”、江蘇高校優勢學科建設工程和“雙一流”的重點建設，東南大學學科結構不斷完善、學科競爭力持續提升。2017年9月，學校進入一流大學建設高校A類名單，11個學科入選一流學科名單，包括：材料科學與工程、電子科學與技術、信息與通信工程、控制科學與工程、計算機科學與技術、建筑學、土木工程、交通運輸工程、生物醫學工程、風景園林學、藝術學理論等，入選學科數位列全國第8。在教育部學位與研究生教育發展中心組織的第四輪學科評估中，獲得A+的學科5個，分別為建筑學、土木工程、交通運輸工程、生物醫學工程、藝術學理論，獲得A+的學科數并列全國高校第8位。

東南大學學科不斷做大做強的發展進程中，研究生院始終注重教育模式的創新和研究生培養質量的提高。研究生教育的核心使命是培養滿足國家需要的高層次拔尖創新人才，問題的關鍵是如何提高研究生的培養質量。經過二十多年的探索與實踐，東南大學研究生院持續創新教育模式，建立了一整套行之有效的研究生培養質量保障體系。

第一，多種措施并舉，吸引優秀生源。優秀生源是提高研究生培養質量的重要基礎。東南大學采取多種措施，優化和完善推免生考核選拔機制；全面實行博士研究生招生申請考核制；設立博士新生獎學金；積極推進碩士研究生考試招生改革，分類考試，優化初試科目和內容，強化復試考核，加強能力考查，注重綜合評價，建立健全更加科學有效、公平公正的考核選拔體系。

第二，拓寬知識領域，改善知識結構。高層次拔尖創新人才不僅需要具有堅實的專業基礎知識，而且需要具有廣博的相關領域知識。為了順應現代科學技術發展的大趨勢，東南大學在加強通識教育的基礎上，積極探索寬口徑拔尖創新人才培養模式，努力為每一位研究生構建一個合理的知識結構。

第三，積極推進研究生教育教學改革，穩步提升學位論文質量。在優化課程體系、加強課程建設、轉變教學模式的基礎上，東南大學逐步建立健全研究生教學質量檢查與評估體系，設立優秀博士學位論文培育基金，鼓勵研究生在校期間刻苦學習、潛心研究。

第四，完善國際化人才培養體系，努力培養具有國際視野的拔尖創新人才。加大對研究生出國學習交流的支持力度，大力推進聯合辦學。與美國麻省理工學院、加州大學伯克利分校等眾多世界一流大學和高水平研究機構建立了緊密合作交流關系。

經過長期不懈努力，東南大學的研究生教育正以“全球高端、實質合作、引領發展”為方向，加快形成全方位、有重點、多層次、寬領域、高水平的新格局。面向新時代，為了適應研究生教育發展的新環境，研究生院以“立德樹人、服務需求、提高質量、追求卓越”為主線，優化結構布局，改革培養模式，健全質量保障，擴大國際合作，推動培養體制機制創新，全面提升研究生教育水平和學位授予質量，努力造就具有家國情懷和國際視野、擔當引領未來和造福人類的領軍人才，為實現高等教育強國目標，為實現中華民族偉大復興的中國夢做出新的、更大的、引領性的貢獻。力爭到2025年，建成具有中國特色、世界一流的研究生培養基地，具有一流的學科、一流的培養條件、一流的管理水平和一流的培養質量，研究生教育在全國高等教育中發揮示范引領作用，并具有較大國際影響力。到2030年，研究生教育水平國際一流，躋身世界一流大學行列。（2021年12月更新）